یکی از صنایع بسیار با اهمیت در سطح جهانی در بخش بیوتکنولوژی، بیوتکنولوژی ریزجلبک ها می باشد. از جلبک ها می توان فراورده های فراسودمند نظیر غذا-داروها و لوازم آرایشی و بهداشتی، خوراک دام، طیور و آبزیان بدست آورد. نیاز روز افزون صنایع مختلف به بیومس جلبک و ترکیبات با ارزشی چون کاروتنوئیدها، اسیدهای چرب ضروری امگا 3 و فیکوسیانین و عدم تولید این محصولات در داخل، توجه اساسی به تولید آن را در کشور می طلبد. برای مثال سالانه حدود 200 تن بتاکاروتن با فرمولاسیون های مختلف وارد کشور می شود. دراین راستا پژوهشکده با راهبرد کارامد سازی اقدام به اجرای برنامه طراحی فتوبیو راکتورهای تولید ریز جلبک ها و فراورده های زیستی با ارزش از آن ها نموده است.