ایران از نظر سطح کشت تجاری، مرغوبیت ارقام و با تولید سالانه 900 هزار تن انار رتبه اول جهان را به خود اختصاص داده است. میزان عملکرد در ایران نیز در حدود 13 تن در هر هکتار است. ایران علاوه بر مرکز پیدایش انار و رویشگاه طبیعی آن، مرکز تنوع ارقام نیز بوده و غنیترین مخازن ژنی انار جهان را دارد که بایستی علاوه بر حفظ و نگهداری این ثروت های ملی و سرمایه های طبیعی، در برنامه های به نژادی و اصلاحی تحقیقات انار کشور مورد توجه قرار گیرند. در حال حاضر اطلاعات جامعی در مورد مشخصات جامع مورفولوژیک، متابولیت ها و مولکولی ارقام و ژنوتیپ های انار ایران، به صورت مدون و علمی در دسترس نمی باشد. بنابراین ایجاد برنامه تلفیقی گزینش ارقام و ژنوتیپ ها بمنظور تشکیل کلکسیون هسته و اصلاحی با روشهای اصلاح کلاسیک و مولکولی در راستای تسریع و افزایش دقت در روند برنامه های اصلاحی انار، و معرفی ژنوتیپ های برتر به منظور افزایش تولید ناشی از تغییرات اقلیمی از اهداف اقتصادی کلان در اصلاح مولکولی ارقام انار می باشد.